Aud Helen undersøker hvordan klima- og miljøendringer påvirker naturen vår, spesielt i fjellet og i arktiske strøk. Gjennom praktiske forsøk ute i naturen og innsamling av store mengder forskningsdata prøver hun å forstå hvordan planter og økosystemer reagerer på et miljø i endring.

Aud Helen er også svært opptatt av naturforvaltning, og ser blant annet på hvordan beitedyr kan brukes som et verktøy for å ta bedre vare på sårbar natur. Som forsker og fagekspert arbeider hun både nasjonalt og internasjonalt. Hun har blant annet vært medforfatter av Naturpanelet (IPBES) sin rapport om fremmede arter, og er med på å vurdere og overvåke den økologiske tilstanden i norske skoger og fjelløkosystemer.